南京口岸開展基因組測序檢測,發(fā)現(xiàn)全新環(huán)狀新病毒
從江蘇出入境檢驗檢疫局(以下簡稱江蘇檢驗檢疫局)了解到,近日,該局聯(lián)合江蘇省衛(wèi)生和計劃生育委員會(以下簡稱江蘇省衛(wèi)生計生委),在對一例經(jīng)南京口岸入境既往發(fā)熱患者的生物樣本進行病毒宏基因組測序檢測時,發(fā)現(xiàn)了一種全新的感染人體的環(huán)狀病毒。
病毒的發(fā)現(xiàn)及研究對防治人類和動植物疾病等各方面具重要意義
據(jù)悉,這位男性患者是一名從新加坡回國的勞務(wù)人員,在經(jīng)南京祿口國際機場入境時,紅外體溫監(jiān)測儀顯示其體溫超過37℃。南京檢驗檢疫局口岸檢疫人員復(fù)測確認該男子處于發(fā)熱狀態(tài),立即對其進行了詳細的流行病學(xué)調(diào)查和醫(yī)學(xué)排查,并在知情同意后采集了血液、尿液、唾液等生物學(xué)樣本。經(jīng)口岸現(xiàn)場快速篩查和江蘇國際旅行衛(wèi)生保健中心實驗室病原體檢測,排除了其感染寨卡病毒、黃熱病毒、登革熱病毒、瘧原蟲、西尼羅熱病毒和基孔肯雅熱病毒等多種病原體的可能。
近期,江蘇檢驗檢疫局與江蘇省衛(wèi)生計生委聯(lián)合對口岸既往多份發(fā)熱患者的生物樣本進行宏基因組測序檢測,在上述患者的生物樣本中發(fā)現(xiàn)了一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒片段,通過進一步測序、序列組裝、PCR擴增,得到完整的病毒基因組。該病毒基因組全長由3018個核苷酸組成,編碼2個主要蛋白。經(jīng)與現(xiàn)有基因庫比對,與該病毒[much]相似的為豬糞相關(guān)的環(huán)狀病毒-5(PoSCV5),但其核苷酸同源性僅為84%,氨基酸同源性低于50%。經(jīng)過專家復(fù)核,認為這是一種在人體首次檢出的新型環(huán)狀單鏈DNA病毒。
對于該病毒的致病性,江蘇國際旅行衛(wèi)生保健中心孫立新博士表示,目前還不能明確該環(huán)狀病毒與患者所患疾病的關(guān)聯(lián)性。病毒結(jié)構(gòu)與致病性不存在特別關(guān)系,不能僅從環(huán)狀來判斷它的致病性有無及強弱;相關(guān)性需要做進一步研究才能確定。
目前,江蘇國際旅行衛(wèi)生保健中心和江蘇省疾病預(yù)防控制中心正在對該病毒進行分離培養(yǎng),以進一步開展其生物學(xué)特征、流行病學(xué)特點、可能的致病性等研究,并繼續(xù)隨訪該患者及其家屬和相關(guān)人員,適時進行詳細的流行病學(xué)調(diào)查和生物樣本檢測工作。
據(jù)權(quán)威人士介紹,病毒在自然界分布廣泛,但直到19世紀末,病毒才開始逐漸被發(fā)現(xiàn)和鑒定。目前,國際病毒分類委員會(ICTV)報告認可的病毒有數(shù)千種。病毒的發(fā)現(xiàn)及研究對防治人類和動植物疾病,以及對分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)、疫苗研制及基因工程等都具有重要意義。
攜手構(gòu)建全鏈條的口岸傳染病防控體系
出入境人員衛(wèi)生檢疫是檢驗檢疫核心工作之一,直接關(guān)系公共衛(wèi)生安全。江蘇檢驗檢疫局構(gòu)建了疫情風(fēng)險評估、現(xiàn)場檢疫查驗、實驗室檢測、信息通報、后續(xù)追蹤全鏈條的口岸傳染病防控體系。
在口岸一線,檢驗檢疫部門遵循“逢警必處、科學(xué)檢疫”的旅客檢疫規(guī)則,做到不同航線飛機分類管理,風(fēng)險防控,嚴格檢疫,科學(xué)處置,保證快速通關(guān)又有效維護口岸安全;同時加強與口岸部門合作,確??诎兑咔榧皶r得到理想中處置。江蘇局著力提升技術(shù)支撐能力,打造全國系統(tǒng)力爭上游的口岸衛(wèi)生監(jiān)測技術(shù)平臺,高水平的實驗室和專業(yè)的檢測人員,為一線工作提供了有力的技術(shù)支撐,實現(xiàn)“檢得出、檢得準、檢得快”。